Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 9030619P08Rik-201ENSMUST00000096397 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Dhx30-215ENSMUST00000198425 3968 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cwc22-203ENSMUST00000111819 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ces2c-201ENSMUST00000055052 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Lin7a-202ENSMUST00000105280 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Tcp10b-201ENSMUST00000086787 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm7353-201ENSMUST00000069044 2866 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Arhgap28-203ENSMUST00000164647 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Nek11-201ENSMUST00000038648 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Flad1-201ENSMUST00000050398 3007 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ldlr-202ENSMUST00000213114 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 C2-205ENSMUST00000148431 1946 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms