Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn2bP55271 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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