Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms