Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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Tmod1P49813 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Tmod1P49813 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Tmod1P49813 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Tmod1P49813 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Tmod1P49813 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Tmod1P49813 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms