Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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PtpreP49446 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtpreP49446 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtpreP49446 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtpreP49446 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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