Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18528 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18528 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18528 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18528 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18528 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18528 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18528 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18528 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
P18528 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms