Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pou4f1P17208 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms