Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Dhcr7-201ENSMUST00000073878 2815 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Olfr1419-201ENSMUST00000087857 1160 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms