Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Scgb2b26-201ENSMUST00000085623 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms