Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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PdgfrbP05622 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfrbP05622 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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