Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01654 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01654 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01654 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01654 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01654 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01654 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01654 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01654 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01654 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01654 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01654 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01654 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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