Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm2056J3QQ02 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm2056J3QQ02 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm2056J3QQ02 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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