Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20795J3QP49 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms