Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm10378F6XQQ1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm10378F6XQQ1 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm10378F6XQQ1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm10378F6XQQ1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm10378F6XQQ1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm10378F6XQQ1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm10378F6XQQ1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm10378F6XQQ1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm10378F6XQQ1 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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