Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21876F6XK35 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms