Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Zfp988F6VKC7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Zfp988F6VKC7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Zfp988F6VKC7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms