Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Zbed5B2RPU8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms