Protein–RNA interactions for Protein: A2CG71

Btbd35f19, BTB domain-containing 35, family member 19, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f19A2CG71 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Ccrl2-201ENSMUST00000111888 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Btbd35f19A2CG71 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms