Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lcn6A2AJB9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lcn6A2AJB9 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lcn6A2AJB9 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lcn6A2AJB9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lcn6A2AJB9 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lcn6A2AJB9 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lcn6A2AJB9 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Lcn6A2AJB9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lcn6A2AJB9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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