Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms