Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprfA2A8L5 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprfA2A8L5 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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