Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CcniQ9Z2V9 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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