Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms