Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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