Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Vmn1r53Q9EP93 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vmn1r53Q9EP93 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Vmn1r53Q9EP93 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Vmn1r53Q9EP93 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vmn1r53Q9EP93 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vmn1r53Q9EP93 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vmn1r53Q9EP93 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vmn1r53Q9EP93 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Vmn1r53Q9EP93 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r53Q9EP93 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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