Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf6Q9DBU5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf6Q9DBU5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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