Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smg9Q9DB90 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms