Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms