Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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