Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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