Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc83Q9D4V3 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms