Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Zbed3Q9D0L1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Zbed3Q9D0L1 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Zbed3Q9D0L1 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Zbed3Q9D0L1 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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