Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ubqln4Q99NB8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms