Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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