Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms