Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms