Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc28aQ8CEI3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc28aQ8CEI3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc28aQ8CEI3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc28aQ8CEI3 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc28aQ8CEI3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms