Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccdc17Q8CE13 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccdc17Q8CE13 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc17Q8CE13 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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