Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms