Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp54Q8BL06 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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