Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms