Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms