Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms