Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm28841-201ENSMUST00000191284 695 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21813-201ENSMUST00000191291 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21878-201ENSMUST00000191365 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21855-201ENSMUST00000191596 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm20833-201ENSMUST00000192708 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21907-201ENSMUST00000192989 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm20928-201ENSMUST00000192992 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm20851-201ENSMUST00000193038 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm37476-201ENSMUST00000193046 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21678-201ENSMUST00000193567 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21768-201ENSMUST00000194103 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm20836-201ENSMUST00000194582 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm21660-201ENSMUST00000195789 696 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
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NipblQ6KCD5 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
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NipblQ6KCD5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
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NipblQ6KCD5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
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NipblQ6KCD5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
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NipblQ6KCD5 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
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NipblQ6KCD5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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NipblQ6KCD5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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NipblQ6KCD5 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NipblQ6KCD5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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