Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Mvb12bQ6KAU4 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Mvb12bQ6KAU4 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mvb12bQ6KAU4 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms