Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pkp4Q68FH0 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pkp4Q68FH0 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pkp4Q68FH0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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