Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ctnna3Q65CL1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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