Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm6682-201ENSMUST00000169666 1346 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 AC113282.4-201ENSMUST00000225273 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms