Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms