Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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